index - Mécanismes Moléculaires d'Adaptation et de Plasticité

Equipe 2MAP

"Mécanismes Moléculaires d'Adaptation et de Plasticité"

 

Approches intégratives visant à caractériser les mécanismes moléculaires d'interaction des hôtes vis-à-vis de leurs pathogènes sous influence environnementale.

Dans l’équipe 2MAP, nous caractérisons les processus cellulaires et moléculaires impliqués dans les interactions hôte / symbiote / pathogène pour comprendre l’adaptation des organismes hôtes. Nous étudions en particulier les mécanismes immunitaires de l’hôte et leur plasticité face aux contraintes biotiques et abiotiques. Afin d’atteindre ces objectifs, nous travaillons sur des systèmes expérimentaux animaux simplifiés en utilisant des génotypes sélectionnés aux phénotypes contrastés. Nous travaillons sur des modèles invertébrés d’intérêt économique et en santé humaine et animale, pour étudier des maladies d’étiologie complexe. Nous utilisons et intégrons des approches «omiques», comme la génomique, la transcriptomique, et l’épigénomique, et également des méthodes de biologie fonctionnelle, comme la transgénèse ou l’invalidation de gènes.

 

ACCES AUX PUBLICATIONS

 

Responsables de l'équipe
- Benjamin Gourbal, Maître de conférences UPVD
- Viviane Boulo, Chargée de Recherches Ifremer

 
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MOTS CLES

ChIP single-strand DNA sequencing Computational pipelines Double-strand break mapping Meiotic hotspot Phylogeography Competence Chromatin structure Hemocytes Epigenetics Biodiversity 5mC Oyster Ddm1 Biomphalysin Shrimp Crassostrea gigas Biomarqueurs bactériens Biofouling Aluminum Cobalt Heterochromatin protein 1 Transposable element Clarity DNMT inhibitors Bacteria Aerolysin Biomarkers Mollusk Abalone Microbiota Pocillopora acuta Active microbiota rearing water core microbiome specific microbiome larvae shrimp 3D imaging Communautés procaryotiquecs actives Blood fluke Daphnia pulex Active bacteriota Color change Depth ChIPmentation Clam DNA methylation inhibitor Bulinus truncatus Rearing water Eggs Core microbiome HP1 Aquatic ecosystems Nauplii Annelids Development Crevette bleue du Pacifique Epigenetic Antibiotic Climate change Cholesteryl TEG Metabarcoding Larvae Antibacterial peptide Core microbiota Non-redundant genomes Schistosoma Catharanthus roseus Biomphalaria glabrata Cercariae Chemical composition Biodiversity loss Coral epigenetic OsHV-1 Genetic diversity Bio-surveillance proxies Biomphalaria B glabrata Bilharziella polonica Cupped oyster Viral spread Bacterial biomarkers Commensal microorganisms Pocillopora damicornis 5-Methylcytosine Cours d'eau Chromatin Cost of resistance 3D histochemistry Blocking primer Chrome Active microbiota Shrimps Corse Sporocysts Chemical pollutants Bivalve Transmissible Neoplasia Biomphalaria snail Schistosoma mansoni Evolution Crop protection ChIP-seq DNA methylation Beta defensin Aquaculture ATAC-seq BgTEP1 Histone H3 clipping Active prokaryotic communities

 

 

 

 

 

RECHERCHE

 

NOMBRE DE REFERENCES BIBLIOGRAPHIQUES

75 Publications avec texte intégral

 

 

TAUX D'OPEN ACCESS

83 %